Из-за того, что морские свинки расщепляют много целлюлозы у них очень длинная кишка, которая достигает более 2-х метров.

Длина двенадцатиперстной кишки достигает в среднем 12 см., подвздошной и тонкой – 120 см., слепой – 15 см., толстой – 80 см., вследствие чего пищеварение занимает много времени. Еда из желудка выходит через час после приема пищи и может продлится до семи часов. Однако окончательный выход пищи из кишечника может занять целую неделю. Это объясняется не только длиной кишки, но и расположением пищи в желудке – она лежит слоями. Также не рекомендуется часто менять корм, это может вызвать расстройство пищеварения. Следует уделять внимание сбалансированному питанию, потому как в результате неправильного питания возникают различные болезни у морских свинок. Некачественный корм может послужить поводом для серьезных заболеваний. К смерти животного может привести расстройство микрофлоры кишечника, которая служит для расщепления целлюлозы.

Если не использовать готовый корм, то меню морской свинки будет очень дорогим, так как в ее рационе должно содержаться как минимум 20% чистых протеинов, 15% необработанного волокна и 4% животного белка. Очень важно, чтобы у животного было достаточное количество сена. В результате эволюции морские свинки не способны синтезировать витамин С, поэтому им надо получать его вместе с пищей. Для этих целей подойдут семечки, злаки, овощи, картофель, трава, репа, одуванчики, капуста, яблоки, помидоры, сено и проч. Причем ежедневно, вместе с питьевой водой необходимо давать зверьку минимум 5 мг витамина С. Также надо учитывать и то, что животному каждый день надо аскорбиновая кислота (1 мл воды/1 мг), которую разводят в свежей воде. 

Если кормить морскую свинку концентратами, нужно помнить, что ей ежедневно необходимо 20 мг витамина С. Поэтому многие ветеринары рекомендуют для кормления животного готовый корм.

При беременности морские свинки нуждаются в глюкозе, поэтому у них есть предрасположенность к кетозу. В этот период необходимо уделять много внимания именно сбалансированному питанию.

Морским свинкам нужно съедать свой помет для того чтобы оставаться здоровыми, причем количество съеденного помета может быть разным. Для того чтобы у молодых морских свинок образовалась флора кишечника им нужно есть помет матери.